• Article  

      Cellular HIV-1 DNA levels in drug sensitive strains are equivalent to those in drug resistant strains in newly-diagnosed patients in Europe 

      Demetriou, Victoria L.; van de Vijver, D. A. M. C.; Kousiappa, Ioanna; Balotta, Claudia; Clotet, B.; Grossman, Z.; Jørgensen, L. B.; Lepej, S. Z.; Levy, I.; Nielsen, C.; Paraskevis, Dimitrios N.; Poljak, M.; Roman, F.; Ruiz, L.; Schmidt, J. -C; Vandamme, A. -M; van Laethem, K. V.; Vercauteren, J.; Kostrikis, Leontios G. (2010)
      Background HIV-1 genotypic drug resistance is an important threat to the success of antiretroviral therapy and transmitted resistance has reached 9% prevalence in Europe. Studies have demonstrated that HIV-1 DNA load in ...
    • Article  

      Development of a molecular-beacon-based multi-allelic real-time RT-PCR assay for the detection of human coronavirus causing severe acute respiratory syndrome (SARS-CoV): A general methodology for detecting rapidly mutating viruses 

      Hadjinicolaou, Andreas V.; Farcas, Gabriella A.; Demetriou, Victoria L.; Mazzulli, T.; Poutanen, Susan M.; Willey, B. M.; Low, D. E.; Butany, Jagdish W.; Asa, S. L.; Kain, K. C.; Kostrikis, Leontios G. (2011)
      Emerging infectious diseases have caused a global effort for development of fast and accurate detection techniques. The rapidly mutating nature of viruses presents a major difficulty, highlighting the need for specific ...
    • Doctoral Thesis  Open Access

      Genetic studies on the Hepatitis C virus 

      Demetriou, Victoria L. (Πανεπιστήμιο Κύπρου, Σχολή Θετικών και Εφαρμοσμένων Επιστημών / University of Cyprus, Faculty of Pure and Applied Sciences, 2010-12)
      Το κείμενο αυτό ασχολείται με την μελέτη της γενετικής ποικιλότητας του HCV. Στο πρώτο μέρος περιγράφεται για πρώτη φορά η μοριακή επιδημιολογία της HCV λοίμωξης στην Κύπρο ανάμεσα στο γενικό πληθυσμό και σε ομάδες υψηλού ...
    • Article  

      Hepatitis C infection among intravenous drug users attending therapy programs in Cyprus 

      Demetriou, Victoria L.; Van De Vijver, D. A. M. C.; Hezka, Johana; Kostrikis, Leontios G.; Savvopoulou, Natasa; Georgiades, Neoklis; Charilaou, Charis C.; Argyriou, Argyris; Pavlou, Tina; Platritis, Kyriakos; Veresies, Kyriakos L. (2010)
      The most high-risk population for HCV transmission worldwide today are intravenous drug users. HCV genotypes in the general population in Cyprus demonstrate a polyphyletic infection and include subtypes associated with ...
    • Article  

      Hepatitis C infection among intravenous drug users attending therapy programs in Cyprus (Journal of Medical Virology (2010) 82, (263-270)) 

      Demetriou, Victoria L.; Van De Vijver, D. A. M. C.; Hezka, Johana; Kostrikis, Leontios G. (2010)
    • Article  

      Increase in transmitted resistance to non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors among newly diagnosed HIV-1 infections in Europe 

      Moutschen, M.; Frentz, D.; Van de Vijver, D. A. M. C.; Abecasis, A. B.; Albert, Jan; Hamouda, O.; Jørgensen, L. B.; Ku¨cherer, C.; Struck, D.; Schmit, J. -C; Vercauteren, J.; A˚sjo¨, B.; Balotta, Claudia; Beshkov, Danail; Camacho, Ricardo J.; Clotet, B.; Coughlan, S.; Griskevicius, A.; Grossman, Z.; Horban, A.; Kolupajeva, T.; Korn, K.; Kostrikis, Leontios G.; Liitsola, K.; Linka, M.; Nielsen, C.; Otelea, D.; Paraskevis, Dimitrios N.; Paredes, R.; Poljak, M.; Puchhammer, Stockl E.; So¨nnerborg, A.; Stanekova, D.; Stanojevic, M.; Van Wijngaerden, E.; Wensing, A. M. J.; Boucher, C. A. B.; Puchhammer, Stockl E.; Sarcletti, M.; Schmied, B.; Geit, M.; Balluch, G.; Vandamme, A. -M; Vercauteren, J.; Derdelinckx, I.; Sasse, A.; Bogaert, M.; Ceunen, H.; De Roo, A.; De Wit, S.; Echahidi, F.; Fransen, K.; Goffard, J. -C; Goubau, P.; Goudeseune, E.; Yombi, J. -C; Lacor, P.; Liesnard, C.; Pierard, D.; Rens, R.; Schrooten, Y.; Vaira, D.; Vandekerckhove, L. P. R.; Van den Heuvel, A.; Van Der Gucht, B.; Van Ranst, M.; Van Wijngaerden, E.; Vandercam, B.; Vekemans, M.; Verhofstede, C.; Clumeck, N.; Van Laethem, K.; Demetriades, Ioannis; Kousiappa, Ioanna; Demetriou, Victoria L.; Hezka, Johana; Bruckova, M.; Linka, M.; Machala, L.; Nielsen, C.; Jørgensen, L. B.; Gerstoft, J.; Mathiesen, L.; Pedersen, C.; Nielsen, H.; Laursen, A.; Kvinesdal, B.; Salminen, M.; Ristola, M.; Liitsola, K.; Suni, J.; Sutinen, J.; Korn, K.; Ku¨cherer, C.; Berg, T.; Braun, P.; Poggensee, G.; Da¨umer, M.; Eberle, J.; Heiken, H.; Kaiser, R.; Knechten, H.; Mu¨ller, H.; Neifer, S.; Schmidt, B.; Walter, H.; Gunsenheimer-Bartmeyer, B.; Harrer, T.; Paraskevis, Dimitrios N.; Hatzakis, Angelos E.; Magiorkinis, Emmanouil N.; Hatzitheodorou, Eleni; Haida, Catherine; Zavitsanou, Assimina; Magiorkinis, Gkikas; Lazanas, Marios C.; Chini, Maria C.; Magafas, N.; Tsogas, Nickolaos; Paparizos, Vassilios A.; Kourkounti, Sofia; Antoniadou, Anastasia C.; Papadopoulos, Antonios I.; Panagopoulos, Periklis; Poulakou, Garyphallia G.; Sakka, V.; Chryssos, Georgios; Drimis, Stylianos; Gargalianos, Panagiotis; Lelekis, Moyssis I.; Chilomenos, G.; Psichogiou, Mina A.; Daikos, George L.; Panos, George; Haratsis, G.; Kordossis, Theodore; Kontos, Athanasios N.; Koratzanis, Georgios; Theodoridou, Maria C.; Mostrou, Glykeria J.; Spoulou, Vana I.; Coughlan, S.; De Gascun, C.; Byrne, C.; Duffy, M.; Bergin, C.; Reidy, D.; Farrell, G.; Lambert, J.; O'Connor, E.; Rochford, A.; Low, J.; Coakely, P.; O'Dea, S.; Hall, W.; Grossman, Z.; Levi, I.; Chemtob, D.; Balotta, Claudia; Riva, C.; Mussini, C.; Caramma, I.; Capetti, A.; Colombo, M. C.; Rossi, C.; Prati, F.; Tramuto, F.; Vitale, F.; Ciccozzi, M.; Angarano, G.; Rezza, G.; Schmit, J. C.; Struck, D.; Hemmer, R.; Arendt, V.; Staub, T.; Schneider, F.; Roman, F.; Wensing, A. M. J.; Boucher, C. A. B.; Van Kessel, A.; van Bentum, P. H. M.; Brinkman, K.; op de Coul, E. L.; van der Ende, M. E.; Hoepelman, I.; van Kasteren, M.; Juttmann, J.; Kuipers, M.; Langebeek, N.; Richter, C.; Santegoets, R.; Schrijnders-Gudde, L.; Schuurman, R.; van de Ven, B. J. M.; A˚sjo¨, B.; Ormaasen, V.; Aavitsland, P.; Horban, A.; Stanczak, J. J.; Stanczak, G. P.; Firlag-Burkacka, E.; Wiercinska-Drapalo, A.; Jablonowska, E.; Malolepsza, E.; Leszczyszyn-Pynka, M.; Szata, W.; Camacho, Ricardo J.; Palma, C.; Borges, F.; Paixa&tild; o, T.; Duque, V.; Araújo, F.; Jevtovic, D.; Salemovic, D.; Stanekova, D.; Habekova, M.; Mokráš, Miloš; Truska, P.; Poljak, M.; Lunar, M.; Babic, Dunja Z.; Tomazic, J.; Vidmar, L.; Vovko, T.; Karner, P.; Clotet, B.; Domingo, P.; Galindo, M. J.; Miralles, C.; del Pozo, M. A.; Ribera, E.; Iribarren, J. A.; Ruiz, L.; de la Torre, J.; Vidal, F.; Garcia, F.; Paredes, R.; Albert, Jan; Heidarian, A.; Aperia-Peipke, K.; Axelsson, M.; Mild, M.; Karlsson, A.; So¨nnerborg, A.; Thalme, A.; Nave´r, L.; Bratt, G.; Karlsson, A.; Blaxhult, A.; Gissle´n, M.; Svennerholm, B.; Bergbrant, I.; Björkman, Per; Sa¨ll, C.; Mellgren, A˚; Lindholm, A.; Kuylenstierna, N.; Montelius, R.; Azimi, F.; Johansson, B.; Carlsson, M.; Johansson, E.; Ljungberg, B.; Ekvall, H.; Strand, A.; Ma¨kitalo, S.; o¨berg, S.; Holmblad, P.; Ho¨fer, M.; Holmberg, H.; Josefson, P.; Ryding, U. (2014)
      Background: One out of ten newly diagnosed patients in Europe was infected with a virus carrying a drug resistant mutation. We analysed the patterns over time for transmitted drug resistance mutations (TDRM) using data ...
    • Article  

      Limited cross-border infections in patients newly diagnosed with HIV in Europe 

      Moutschen, M.; Frentz, D.; Wensing, A. M. J.; Albert, Jan; Paraskevis, Dimitrios N.; Abecasis, A. B.; Hamouda, O.; Jørgensen, L. B.; Kücherer, C.; Struck, D.; Schmit, J. -C; Åsjö, Birgitta; Balotta, Claudia; Beshkov, Danail; Camacho, Ricardo J.; Clotet, B.; Coughlan, S.; De Wit, S.; Griskevicius, A.; Grossman, Z.; Horban, A.; Kolupajeva, T.; Korn, K.; Kostrikis, Leontios G.; Liitsola, K.; Linka, M.; Nielsen, C.; Otelea, D.; Paredes, R.; Poljak, M.; Puchhammer-Stöckl, E.; Sönnerborg, A.; Stanekova, D.; Stanojevic, M.; Vandamme, A. -M; Boucher, C. A. B.; Van de Vijver, D. A. M. C.; Balluch, G.; Vandamme, A. -M; Vercauteren, J.; Derdelinckx, I.; Sasse, A.; Bogaert, M.; Ceunen, H.; De Roo, A.; De Wit, S.; Echahidi, F.; Fransen, K.; Goffard, J. -C; Goubau, P.; Goudeseune, E.; Yombi, J. -C; Lacor, P.; Liesnard, C.; Pierard, D.; Rens, R.; Schrooten, Y.; Vaira, D.; Vandekerckhove, L. P. R.; Van den Heuvel, A.; Van Der Gucht, B.; Van Ranst, M.; Van Wijngaerden, E.; Vandercam, B.; Vekemans, M.; Verhofstede, C.; Clumeck, N.; Van Laethem, K.; Demetriades, Ioannis; Kousiappa, Ioanna; Demetriou, Victoria L.; Hezka, Johana; Bruckova, M.; Linka, M.; Machala, L.; Nielsen, C.; Jørgensen, L. B.; Gerstoft, J.; Mathiesen, L.; Pedersen, C.; Nielsen, H.; Laursen, A.; Kvinesdal, B.; Salminen, M.; Ristola, M.; Liitsola, K.; Suni, J.; Sutinen, J.; Korn, K.; Kücherer, C.; Berg, T.; Braun, P.; Poggensee, G.; Däumer, M.; Eberle, J.; Hamouda, O.; Heiken, H.; Kaiser, R.; Knechten, H.; Müller, H.; Neifer, S.; Schmidt, B.; Walter, H.; Gunsenheimer-Bartmeyer, B.; Harrer, T.; Paraskevis, Dimitrios N.; Hatzakis, Angelos E.; Magiorkinis, Emmanouil N.; Hatzitheodorou, Eleni; Haida, Catherine; Zavitsanou, Assimina; Magiorkinis, Gkikas; Lazanas, Marios C.; Chini, Maria C.; Magafas, N.; Tsogas, Nickolaos; Paparizos, Vassilios A.; Kourkounti, Sofia; Antoniadou, Anastasia C.; Papadopoulos, Antonios I.; Panagopoulos, Periklis; Poulakou, Garyphallia G.; Sakka, V.; Chryssos, Georgios; Drimis, Stylianos; Gargalianos, Panagiotis; Lelekis, Moyssis I.; Chilomenos, G.; Psichogiou, Mina A.; Daikos, George L.; Panos, George; Haratsis, G.; Kordossis, Theodore; Kontos, Athanasios N.; Koratzanis, Georgios; Theodoridou, Maria C.; Mostrou, Glykeria J.; Spoulou, Vana I.; Coughlan, S.; De Gascun, C.; Byrne, C.; Duffy, M.; Bergin, C.; Reidy, D.; Farrell, G.; Lambert, J.; O'Connor, E.; Rochford, A.; Low, J.; Coakely, P.; O'Dea, S.; Hall, W.; Grossman, Z.; Levi, I.; Chemtob, D.; Balotta, Claudia; Franzetti, M.; Lai, A.; Binda, F.; Tramuto, F.; Ciccozzi, M.; Mussini, C.; Angarano, G.; Rezza, G.; Schmit, J. C.; Struck, D.; Hemmer, R.; Arendt, V.; Staub, T.; Schneider, F.; Roman, F.; Wensing, A. M. J.; Boucher, C. A. B.; Van Kessel, A.; van Bentum, P. H. M.; Brinkman, K.; de Coul, E. L.; van der Ende, M. E.; Hoepelman, I. M.; van Kasteren, M.; Juttmann, J.; Kuipers, M.; Langebeek, N.; Richter, C.; Santegoets, R. M. W. J.; Schrijnders-Gudde, L.; Schuurman, R.; van de Ven, B. J. M.; Åsjö, Birgitta; Ormaasen, V.; Aavitsland, P.; Horban, A.; Stanczak, J. J.; Stanczak, G. P.; Firlag-Burkacka, E.; Wiercinska-Drapalo, A.; Jablonowska, E.; Malolepsza, E.; Leszczyszyn-Pynka, M.; Szata, W.; Camacho, Ricardo J.; Palma, C.; Borges, F.; Paixão, T.; Duque, V.; Araújo, F.; Jevtovic, D.; Salemovic, D.; Stanekova, D.; Habekova, M.; Mokráš, Miloš; Truska, P.; Poljak, M.; Lunar, M.; Babic, Dunja Z.; Tomazic, J.; Vidmar, L.; Vovko, T.; Karner, P.; Clotet, B.; Domingo, P.; Galindo, M. J.; Miralles, C.; del Pozo, M. A.; Ribera, E.; Iribarren, J. A.; Ruiz, L.; de la Torre, J.; Vidal, F.; Garcia, F.; Paredes, R.; Albert, Jan; Heidarian, A.; Aperia-Peipke, K.; Axelsson, M.; Mild, M.; Karlsson, A.; Sönnerborg, A.; Thalme, A.; Navér, L.; Bratt, G.; Karlsson, A.; Blaxhult, A.; Gisslén, M.; Svennerholm, B.; Bergbrant, I.; Björkman, Per; Säll, C.; Mellgren, Å.; Lindholm, A.; Kuylenstierna, N.; Montelius, R.; Azimi, F.; Johansson, B.; Carlsson, M.; Johansson, E.; Ljungberg, B.; Ekvall, H.; Strand, A.; Mäkitalo, S.; öberg, S.; Holmblad, P.; Höfer, M.; Holmberg, H.; Josefson, P.; Ryding, U. (2013)
      Background: International travel plays a role in the spread of HIV-1 across Europe. It is, however, not known whether international travel is more important for spread of the epidemic as compared to endogenous infections ...
    • Article  

      Molecular beacon-based real-time PCR detection of primary isolates of salmonella typhimurium and salmonella enteritidis in environmental and clinical samples 

      Hadjinicolaou, Andreas V.; Demetriou, Victoria L.; Emmanuel, M. A.; Kakoyiannis, C. K.; Kostrikis, Leontios G. (2009)
      Background. A fast and simple two-step multiplex real-time PCR assay has been developed to replace the traditional, laborious Salmonella serotyping procedure. Molecular beacons were incorporated into the assay as probes ...
    • Article  

      Molecular epidemiology of hepatitis C infection in Cyprus within the general population and high-risk cohorts 

      Demetriou, Victoria L.; Kostrikis, Leontios G. (2011)
      Background: Initial data on the molecular epidemiology of HCV infection in Cyprus showed a highly polyphyletic infection and multiple points of introduction into the general population. The continuation and expansion of ...
    • Article  

      Molecular epidemiology of hepatitis C infection in cyprus: Evidence of polyphyletic infection 

      Demetriou, Victoria L.; Van De Vijver, D. A. M. C.; Kostrikis, Leontios G.; Chimonides, S.; Evgeniou, N. A.; Hadjigeorgiou-Vounou, E.; Koliou-Mazeri, M.; Papakyriakou, P.; Petsas, L.; Potamitis, G. (2009)
      The genetic diversity of the hepatitis C virus (HCV) in Cyprus is investigated for the first time in this study. Nucleotide sequence analysis of the CORE-E1 and NS5B regions of the HCV genome was performed on blood plasma ...
    • Article  

      Near-full genome characterisation of two natural intergenotypic 2k/1b recombinant hepatitis c virus isolates 

      Demetriou, Victoria L.; Kyriakou, Eftychia; Kostrikis, Leontios G. (2011)
      Few natural intergenotypic hepatitis C virus (HCV) recombinants have been characterised, and only RF1-2k/1b has demonstrated widespread transmission. The near-full length genome sequences for two cases of 2k/1b recombinants ...
    • Article  

      Near-full genome characterization of unclassified hepatitis c virus strains relating to genotypes 1 and 4 

      Demetriou, Victoria L.; Kostrikis, Leontios G. (2011)
      Near-full genome sequences are presented in this report for the first time of unclassified HCV strains amplified using RT-PCR from plasma of patients living in Cyprus. One strain appears to be a unique genotype-1-like ...
    • Article  

      Primary resistance to integrase strand-transfer inhibitors in Europe 

      Moutschen, M.; Casadellà, M.; van Ham, P. M.; Noguera-Julian, M.; van Kessel, A.; Pou, C.; Hofstra, Laura Marije Arije; Santos, J. R.; Garcia, F.; Struck, D.; Alexiev, Ivailo; Bakken Kran, A. M.; Hoepelman, A. I.; Kostrikis, Leontios G.; Somogyi, Sybille; Liitsola, K.; Linka, M.; Nielsen, C.; Otelea, D.; Paraskevis, Dimitrios N.; Poljak, M.; Puchhammer-Stöckl, E.; Staneková, D.; Stanojevic, M.; Van Laethem, K.; Zidovec Lepej, S.; Clotet, B.; Boucher, C. A. B.; Paredes, R.; Wensing, A. M. J.; Puchhammer-Stöckl, E.; Sarcletti, M.; Schmied, B.; Geit, M.; Balluch, G.; Vandamme, A. M.; Vercauteren, J.; Derdelinckx, I.; Sasse, A.; Bogaert, M.; Ceunen, H.; De Roo, A.; De Wit, S.; Echahidi, F.; Fransen, K.; Goffard, J. C.; Goubau, P.; Goudeseune, E.; Yombi, J. C.; Lacor, P.; Liesnard, C.; Pierard, D.; Rens, R.; Schrooten, Y.; Vaira, D.; Vandekerckhove, L. P.; Van den Heuvel, A.; Van Der Gucht, B.; Van Ranst, M.; Van Wijngaerden, E.; Vandercam, B.; Vekemans, M.; Verhofstede, C.; Clumeck, N.; Van Laethem, K.; Beshkov, Danail; Alexiev, Ivailo; Zidovec Lepej, S.; Begovac, J.; Demetriades, Ioannis; Kousiappa, Ioanna; Demetriou, Victoria L.; Hezka, Johana; Linka, M.; Machala, L.; Maly, M.; Nielsen, C.; Jørgensen, L. B.; Gerstoft, J.; Mathiesen, L.; Pedersen, C.; Nielsen, H.; Laursen, A.; Kvinesdal, B.; Liitsola, K.; Ristola, M.; Suni, J.; Sutinen, J.; Hamouda, O.; Kücherer, C.; Berg, T.; Braun, P.; Poggensee, G.; Däumer, M.; Eberle, J.; Heiken, H.; Kaiser, R.; Knechten, H.; Korn, K.; Müller, H.; Neifer, S.; Schmidt, B.; Walter, H.; Gunsenheimer-Bartmeyer, B.; Harrer, T.; Paraskevis, Dimitrios N.; Hatzakis, Angelos E.; Magiorkinis, Emmanouil N.; Hatzitheodorou, Eleni; Haida, Catherine; Zavitsanou, Assimina; Magiorkinis, Gkikas; Lazanas, Marios C.; Chini, Maria C.; Magafas, N.; Tsogas, Nickolaos; Paparizos, Vassilios A.; Kourkounti, Sofia; Antoniadou, Anastasia C.; Papadopoulos, Antonios I.; Panagopoulos, Periklis; Poulakou, Garyphallia G.; Sakka, V.; Chryssos, Georgios; Drimis, Stylianos; Gargalianos, Panagiotis; Lelekis, Moyssis I.; Chilomenos, G.; Psichogiou, Mina A.; Daikos, George L.; Sabatakou, H.; Panos, George; Haratsis, G.; Kordossis, Theodore; Kontos, Athanasios N.; Koratzanis, Georgios; Theodoridou, Maria C.; Mostrou, Glykeria J.; Spoulou, Vana I.; Schmit, J. C.; Struck, D.; Hemmer, R.; Arendt, V.; Staub, T.; Schneider, F.; Roman, F.; Wensing, A. M.; Boucher, C. A.; van de Vijver, D. A.; van Kessel, A.; van, P. H.; Brinkman, K.; Op de, E. L.; van der Ende, M. E.; Hoepelman, I. M.; van Kasteren, M.; Juttmann, J.; Kuipers, M.; Langebeek, N.; Richter, C.; Santegoets, R. M.; Schrijnders-Gudde, L.; Schuurman, R.; van de Ven, B. J.; Åsjö, Birgitta; Bakken, A. M.; Ormaasen, V.; Aavitsland, P.; Otelea, D.; Paraschiv, S.; Tudor, A. M.; Jevtovic, D.; Salemovic, D.; Stanekova, D.; Habekova, M.; Mokráš, Miloš; Truska, P.; Poljak, M.; Lunar, M.; Babic, Dunja Z.; Tomazic, J.; Vidmar, L.; Vovko, T.; Karner, P.; Clotet, B.; Garcia, F.; Domingo, P.; Galindo, M. J.; Miralles, C.; Del, M. A.; Ribera, E.; Iribarren, J. A.; Ruiz, L.; de la Torre, J.; Vidal, F.; Garcia, F.; Paredes, R. (2015)
      Objectives: The objective of this study was to define the natural genotypic variation of the HIV-1 integrase gene across Europe for epidemiological surveillance of integrase strand-transfer inhibitor (InSTI) resistance. ...
    • Article  

      Re-analysis of unassigned hepatitis C virus (HCV) strain CYHCV025: Evidence of a highly divergent lineage within genotype 1 

      Oikonomopoulou, M.; Demetriou, Victoria L.; Kostrikis, Leontios G.; Paraskevis, Dimitrios N. (2017)
      HCV global sequences have been classified into 7 genotypes, several subtypes and a number of unassigned sequences. Our aim was to perform an in depth investigation of the taxonomic relationships of the unclassified CYHCV025 ...
    • Article  

      Transmission of HIV drug resistance and the predicted effect on current first-line regimens in Europe 

      Moutschen, M.; Hofstra, Laura Marije Arije; Sauvageot, Nicolas; Albert, Jan; Alexiev, Ivailo; Garcia, F.; Struck, D.; Van De Vijver, D. A. M. C.; Åsjö, Birgitta; Beshkov, Danail; Coughlan, S.; Descamps, D.; Griskevicius, A.; Hamouda, O.; Horban, A.; Van Kasteren, M.; Kolupajeva, T.; Kostrikis, Leontios G.; Liitsola, K.; Linka, M.; Mor, O.; Nielsen, C.; Otelea, D.; Paraskevis, Dimitrios N.; Paredes, R.; Poljak, M.; Puchhammer-Stöckl, E.; Sönnerborg, A.; Staneková, D.; Stanojevic, M.; Van Laethem, K.; Zazzi, M.; Lepej, S. Z.; Boucher, C. A. B.; Schmit, J. -C; Wensing, A. M. J.; Puchhammer-Stockl, E.; Sarcletti, M.; Schmied, B.; Geit, M.; Balluch, G.; Vandamme, A. M.; Vercauteren, J.; Derdelinckx, I.; Sasse, A.; Bogaert, M.; Ceunen, H.; De Roo, A.; De Wit, S.; Echahidi, F.; Fransen, K.; Goffard, J. -C; Goubau, P.; Goudeseune, E.; Yombi, J. -C; Lacor, P.; Liesnard, C.; Pierard, D.; Rens, R.; Schrooten, Y.; Vaira, D.; Vandekerckhove, L. P. R.; Van Den Heuvel, A.; Van Der Gucht, B.; Van Ranst, M.; Van Wijngaerden, E.; Vandercam, B.; Vekemans, M.; Verhofstede, C.; Clumeck, N.; Van Laethem, K.; Beshkov, Danail; Alexiev, Ivailo; Lepej, S. Z.; Begovac, J.; Kostrikis, Leontios G.; Demetriades, Ioannis; Kousiappa, Ioanna; Demetriou, Victoria L.; Hezka, Johana; Linka, M.; Maly, M.; Machala, L.; Nielsen, C.; Jørgensen, L. B.; Gerstoft, J.; Mathiesen, L.; Pedersen, C.; Nielsen, H.; Laursen, A.; Kvinesdal, B.; Liitsola, K.; Ristola, M.; Suni, J.; Sutinen, J.; Descamps, D.; Assoumou, L.; Castor, G.; Grude, M.; Flandre, P.; Storto, A.; Hamouda, O.; Kücherer, C.; Berg, T.; Braun, P.; Poggensee, G.; Däumer, M.; Eberle, J.; Heiken, H.; Kaiser, R.; Knechten, H.; Korn, K.; Müller, H.; Neifer, S.; Schmidt, B.; Walter, H.; Gunsenheimer-Bartmeyer, B.; Harrer, T.; Paraskevis, Dimitrios N.; Hatzakis, Angelos E.; Zavitsanou, Assimina; Vassilakis, A.; Lazanas, Marios C.; Chini, Maria C.; Lioni, A.; Sakka, V.; Kourkounti, Sofia; Paparizos, Vassilios A.; Antoniadou, Anastasia C.; Papadopoulos, Antonios I.; Poulakou, Garyphallia G.; Katsarolis, I.; Protopapas, K.; Chryssos, Georgios; Drimis, Stylianos; Gargalianos, Panagiotis; Xylomenos, Georgios; Lourida, G.; Psichogiou, Mina A.; Daikos, George L.; Sipsas, N. V.; Kontos, Athanasios N.; Gamaletsou, M. N.; Koratzanis, Georgios; Sambatakou, E.; Mariolis, H.; Skoutelis, A.; Papastamopoulos, V.; Georgiou, O.; Panagopoulos, Periklis; Maltezos, E.; Coughlan, S.; De Gascun, C.; Byrne, C.; Duffy, M.; Bergin, C.; Reidy, D.; Farrell, G.; Lambert, J.; O'Connor, E.; Rochford, A.; Low, J.; Coakely, P.; O'Dea, S.; Hall, W.; Mor, O.; Levi, I.; Chemtob, D.; Grossman, Z.; Zazzi, M.; De Luca, A.; Balotta, Claudia; Riva, C.; Mussini, C.; Caramma, I.; Capetti, A.; Colombo, M. C.; Rossi, C.; Prati, F.; Tramuto, F.; Vitale, F.; Ciccozzi, M.; Angarano, G.; Rezza, G.; Kolupajeva, T.; Kolupajeva, T.; Vasins, O.; Griskevicius, A.; Lipnickiene, V.; Schmit, J. C.; Struck, D.; Sauvageot, Nicolas; Hemmer, R.; Arendt, V.; Michaux, C.; Staub, T.; Sequin-Devaux, C.; Wensing, A. M. J.; Boucher, C. A. B.; Van Kessel, A.; Van Bentum, P. H. M.; Brinkman, K.; Connell, B. J.; Van Der Ende, M. E.; Hoepelman, I. M.; Van Kasteren, M.; Kuipers, M.; Langebeek, N.; Richter, C.; Santegoets, R. M. W. J.; Schrijnders-Gudde, L.; Schuurman, R.; Van De Ven, B. J. M.; Åsjö, Birgitta; Kran, A. -M B.; Ormaasen, V.; Aavitsland, P.; Horban, A.; Stanczak, J. J.; Stanczak, G. P.; Firlag-Burkacka, E.; Wiercinska-Drapalo, A.; Jablonowska, E.; Maolepsza, E.; Leszczyszyn-Pynka, M.; Szata, W.; Camacho, Ricardo J.; Palma, C.; Borges, F.; Paixão, T.; Duque, V.; Araújo, F.; Otelea, D.; Paraschiv, S.; Tudor, A. M.; Cernat, R.; Chiriac, C.; Dumitrescu, F.; Prisecariu, L. J.; Jevtovic, Dj; Salemovic, D.; Stanekova, D.; Habekova, M.; Chabadová, Z.; Drobkova, T.; Bukovinova, P.; Shunnar, A.; Truska, P.; Poljak, M.; Lunar, M.; Babic, Dunja Z.; Tomazic, J.; Vidmar, L.; Vovko, T.; Karner, P.; Garcia, F.; Paredes, R.; Monge, S.; Moreno, S.; Del Amo, J.; Asensi, V.; Sirvent, J. L.; De Mendoza, C.; Delgado, R.; Gutiérrez, F.; Berenguer, J.; Garcia-Bujalance, S.; Stella, Natalia C.; Blanco, J. R.; Dalmau, D.; Rivero, M.; Segura, F.; Elıás, Marıá Jesús Pérez; Alvarez, M.; Chueca, N.; Rodríguez-Martín, C.; Vidal, C.; Palomares, J. C.; Viciana, I.; Viciana, P.; Cordoba, J.; Aguilera, A.; Domingo, P.; Galindo, M. J.; Miralles, C.; Del Pozo, M. A.; Ribera, E.; Iribarren, J. A.; Ruiz, L.; De La Torre, J.; Vidal, F.; Clotet, B.; Albert, Jan; Heidarian, A.; Aperia-Peipke, K.; Axelsson, M.; Mild, M.; Karlsson, A.; Sönnerborg, A.; Thalme, A.; Navér, L.; Bratt, G.; Karlsson, A.; Blaxhult, A.; Gisslén, M.; Svennerholm, B.; Bergbrant, I.; Björkman, Per; Säll, C.; Mellgren, Å.; Lindholm, A.; Kuylenstierna, N.; Montelius, R.; Azimi, F.; Johansson, B.; Carlsson, M.; Johansson, E.; Ljungberg, B.; Ekvall, H.; Strand, A.; Mäkitalo, S.; Öberg, S.; Holmblad, P.; Höfer, M.; Holmberg, H.; Josefson, P.; Ryding, U.; De Los Santos, I. (2016)
      Background. Numerous studies have shown that baseline drug resistance patterns may influence the outcome of antiretroviral therapy. Therefore, guidelines recommend drug resistance testing to guide the choice of initial ...
    • Article  

      Transmission of HIV Drug Resistance and the Predicted Effect on Current First-line Regimens in Europe 

      Moutschen, M.; Hofstra, Laura Marije Arije; Sauvageot, Nicolas; Albert, Jan; Alexiev, Ivailo; Garcia, Federico; Struck, Daniel; Van, de Vijver; Åsjö, Birgitta; Beshkov, Danail; Coughlan, Suzie; Descamps, Diane; Griskevicius, Algirdas; Hamouda, Osamah; Horban, Andrzej; Van Kasteren, Marjo; Kolupajeva, Tatjana; Kostrikis, Leontios G.; Liitsola, Kirsi; Linka, Marek; Mor, Orna; Nielsen, Claus; Otelea, Dan; Paraskevis, Dimitrios N.; Paredes, Roger; Poljak, Mario; Puchhammer-Stöckl, Elisabeth; Sönnerborg, Anders; Staneková, Danica; Stanojevic, Maja; Van Laethem, Kristel; Zazzi, Maurizio; Zidovec Lepej, Snjezana; Boucher, Charles A. B.; Schmit, Jean-Claude; Wensing, Annemarie M. J.; Puchhammer-Stockl, E.; Sarcletti, M.; Schmied, B.; Geit, M.; Balluch, G.; Vandamme, A. M.; Vercauteren, J.; Derdelinckx, I.; Sasse, A.; Bogaert, M.; Ceunen, H.; De Roo, A.; De Wit, S.; Echahidi, F.; Fransen, K.; Goffard, J. -C; Goubau, P.; Goudeseune, E.; Yombi, J. -C; Lacor, P.; Liesnard, C.; Pierard, D.; Rens, R.; Schrooten, Y.; Vaira, D.; Vandekerckhove, L. P. R.; Van, den Heuvel; Van, Der Gucht; Van Ranst, M.; Van Wijngaerden, E.; Vandercam, B.; Vekemans, M.; Verhofstede, C.; Clumeck, N.; Van Laethem, K.; Beshkov, Danail; Alexiev, Ivailo; Lepej, S. Z.; Begovac, J.; Kostrikis, Leontios G.; Demetriades, Ioannis; Kousiappa, Ioanna; Demetriou, Victoria L.; Hezka, Johana; Linka, M.; Maly, M.; Machala, L.; Nielsen, C.; Jørgensen, L. B.; Gerstoft, J.; Mathiesen, L.; Pedersen, C.; Nielsen, H.; Laursen, A.; Kvinesdal, B.; Liitsola, K.; Ristola, M.; Suni, J.; Sutinen, J.; Descamps, D.; Assoumou, L.; Castor, G.; Grude, M.; Flandre, P.; Storto, A.; Hamouda, O.; Kücherer, C.; Berg, T.; Braun, P.; Poggensee, G.; Däumer, M.; Eberle, J.; Heiken, H.; Kaiser, R.; Knechten, H.; Korn, K.; Müller, H.; Neifer, S.; Schmidt, B.; Walter, H.; Gunsenheimer-Bartmeyer, B.; Harrer, T.; Paraskevis, Dimitrios N.; Hatzakis, Angelos E.; Zavitsanou, Assimina; Vassilakis, A.; Lazanas, Marios C.; Chini, Maria C.; Lioni, A.; Sakka, V.; Kourkounti, Sofia; Paparizos, Vassilios A.; Antoniadou, Anastasia C.; Papadopoulos, Antonios I.; Poulakou, Garyphallia G.; Katsarolis, I.; Protopapas, K.; Chryssos, Georgios; Drimis, Stylianos; Gargalianos, Panagiotis; Xylomenos, Georgios; Lourida, G.; Psichogiou, Mina A.; Daikos, George L.; Sipsas, N. V.; Kontos, Athanasios N.; Gamaletsou, M. N.; Koratzanis, Georgios; Sambatakou, H.; Mariolis, H.; Skoutelis, A.; Papastamopoulos, V.; Georgiou, O.; Panagopoulos, Periklis; Maltezos, E.; Coughlan, S.; De Gascun, C.; Byrne, C.; Duffy, M.; Bergin, C.; Reidy, D.; Farrell, G.; Lambert, J.; O'Connor, E.; Rochford, A.; Low, J.; Coakely, P.; O'Dea, S.; Hall, W.; Mor, O.; Levi, I.; Chemtob, D.; Grossman, Z.; Zazzi, M.; de Luca, A.; Balotta, Claudia; Riva, C.; Mussini, C.; Caramma, I.; Capetti, A.; Colombo, M. C.; Rossi, C.; Prati, F.; Tramuto, F.; Vitale, F.; Ciccozzi, M.; Angarano, G.; Rezza, G.; Kolupajeva, T.; Vasins, O.; Griskevicius, A.; Lipnickiene, V.; Schmit, J. C.; Struck, D.; Sauvageot, Nicolas; Hemmer, R.; Arendt, V.; Michaux, C.; Staub, T.; Sequin-Devaux, C.; Wensing, A. M. J.; Boucher, C. A. B.; van, de Vijver; Van Kessel, A.; van Bentum, P. H. M.; Brinkman, K.; Connell, B. J.; van, der Ende; Hoepelman, I. M.; van Kasteren, M.; Kuipers, M.; Langebeek, N.; Richter, C.; Santegoets, R. M. W. J.; Schrijnders-Gudde, L.; Schuurman, R.; van, de Ven; Åsjö, Birgitta; Kran, A. -M B.; Ormaasen, V.; Aavitsland, P.; Horban, A.; Stanczak, J. J.; Stanczak, G. P.; Firlag-Burkacka, E.; Wiercinska-Drapalo, A.; Jablonowska, E.; Maolepsza, E.; Leszczyszyn-Pynka, M.; Szata, W.; Camacho, Ricardo J.; Palma, C.; Borges, F.; Paixão, T.; Duque, V.; Araújo, F.; Otelea, D.; Paraschiv, S.; Tudor, A. M.; Cernat, R.; Chiriac, C.; Dumitrescu, F.; Prisecariu, L. J.; Stanojevic, M.; Jevtovic, Dj; Salemovic, D.; Stanekova, D.; Habekova, M.; Chabadová, Z.; Drobkova, T.; Bukovinova, P.; Shunnar, A.; Truska, P.; Poljak, M.; Lunar, M.; Babic, Dunja Z.; Tomazic, J.; Vidmar, L.; Vovko, T.; Karner, P.; Garcia, F.; Paredes, R.; Monge, S.; Moreno, S.; del Amo, J.; Asensi, V.; Sirvent, J. L.; de Mendoza, C.; Delgado, R.; Gutiérrez, F.; Berenguer, J.; Garcia-Bujalance, S.; Stella, Natalia C.; de, los Santos; Blanco, J. R.; Dalmau, D.; Rivero, M.; Segura, F.; Elıás, Marıá Jesús Pérez; Alvarez, M.; Chueca, N.; Rodríguez-Martín, C.; Vidal, C.; Palomares, J. C.; Viciana, I.; Viciana, P.; Cordoba, J.; Aguilera, A.; Domingo, P.; Galindo, M. J.; Miralles, C.; del Pozo, M. A.; Ribera, E.; Iribarren, J. A.; Ruiz, L.; de, la Torre; Vidal, F.; Clotet, B.; Albert, Jan; Heidarian, A.; Aperia-Peipke, K.; Axelsson, M.; Mild, M.; Karlsson, A.; Sönnerborg, A.; Thalme, A.; Navér, L.; Bratt, G.; Karlsson, A.; Blaxhult, A.; Gisslén, M.; Svennerholm, B.; Bergbrant, I.; Björkman, Per; Säll, C.; Mellgren, Å.; Lindholm, A.; Kuylenstierna, N.; Montelius, R.; Azimi, F.; Johansson, B.; Carlsson, M.; Johansson, E.; Ljungberg, B.; Ekvall, H.; Strand, A.; Mäkitalo, S.; Öberg, S.; Holmblad, P.; Höfer, M.; Holmberg, H.; Josefson, P.; Ryding, U. (2015)
    • Article  

      Treatment-associated polymorphisms in protease are significantly associated with higher viral load and lower CD4 count in newly diagnosed drug-naive HIV-1 infected patients 

      Moutschen, M.; Theys, K.; Deforche, K.; Vercauteren, J.; Libin, P.; van de Vijver, D. A. M. C.; Albert, Jan; Åsjö, Birgitta; Balotta, Claudia; Bruckova, M.; Camacho, Ricardo J.; Clotet, B.; Coughlan, S.; Grossman, Z.; Hamouda, O.; Horban, A.; Korn, K.; Kostrikis, Leontios G.; Kücherer, C.; Nielsen, C.; Paraskevis, Dimitrios N.; Poljak, M.; Puchhammer-Stockl, E.; Riva, C.; Ruiz, L.; Liitsola, K.; Schmit, J. -C; Schuurman, R.; Sönnerborg, A.; Stanekova, D.; Stanojevic, M.; Struck, D.; Van Laethem, K.; Wensing, A. M. J.; Boucher, C. A. B.; Vandamme, A. M.; Puchhammer-Stockl, E.; Sarcletti, M.; Schmied, B.; Geit, M.; Balluch, G.; Vandamme, A. M.; Vercauteren, J.; Derdelinckx, I.; Sasse, A.; Bogaert, M.; Ceunen, H.; De Roo, A.; De Wit, S.; Deforche, K.; Echahidi, F.; Fransen, K.; Goffard, J. -C; Goubau, P.; Goudeseune, E.; Yombi, J. -C; Lacor, P.; Liesnard, C.; Pierard, D.; Rens, R.; Schrooten, Y.; Vaira, D.; Van den Heuvel, A.; Van Der Gucht, B.; Van Ranst, M.; Van Wijngaerden, E.; Vandercam, B.; Vekemans, M.; Verhofstede, C.; Clumeck, N.; Van Laethem, K.; Demetriades, Ioannis; Kousiappa, Ioanna; Demetriou, Victoria L.; Hezka, Johana; Linka, M.; Bruckova, M.; Machala, L.; Nielsen, C.; Jrgensen, L. B.; Gerstoft, J.; Mathiesen, L.; Pedersen, C.; Nielsen, H.; Laursen, A.; Kvinesdal, B.; Liitsola, K.; Ristola, M.; Suni, J.; Sutinen, J.; Korn, K.; K̈ucherer, C.; Berg, T.; Braun, P.; Poggensee, G.; Däumer, M.; Eberle, J.; Heiken, H.; Kaiser, R.; Knechten, H.; Müller, H.; Neifer, S.; Schmidt, B.; Walter, H.; Gunsenheimer-Bartmeyer, B.; Harrer, T.; Hatzakis, Angelos E.; Paraskevis, Dimitrios N.; Magiorkinis, Emmanouil N.; Hatzitheodorou, Eleni; Issaris, C.; Haida, Catherine; Zavitsanou, Assimina; Magiorkinis, Gkikas; Lazanas, Marios C.; Chini, Maria C.; Magafas, N.; Tsogas, Nickolaos; Paparizos, Vassilios A.; Kourkounti, Sofia; Antoniadou, Anastasia C.; Papadopoulos, Antonios I.; Panagopoulos, Periklis; Poulakou, Garyphallia G.; Sakka, V.; Chryssos, Georgios; Drimis, Stylianos; Gargalianos, Panagiotis; Lelekis, Moyssis I.; Xilomenos, G.; Psichogiou, Mina A.; Daikos, George L.; Panos, George; Haratsis, G.; Kordossis, Theodore; Kontos, Athanasios N.; Koratzanis, Georgios; Theodoridou, Maria C.; Mostrou, Glykeria J.; Spoulou, Vana I.; Hall, W.; De Gascun, C.; Byrne, C.; Duffy, M.; Bergin, C.; Reidy, D.; Farrell, G.; Lambert, J.; O'Connor, E.; Rochford, A.; Low, J.; Coakely, P.; Coughlan, S.; Grossman, Z.; Levi, I.; Chemtob, D.; Balotta, Claudia; Riva, C.; Mussini, C.; Caramma, I.; Capetti, A.; Colombo, M. C.; Rossi, C.; Prati, F.; Tramuto, F.; Vitale, F.; Ciccozzi, M.; Angarano, G.; Rezza, G.; Schmit, J. C.; Struck, D.; Hemmer, R.; Arendt, V.; Staub, T.; Schneider, F.; Roman, F.; Wensing, A. M. J.; Boucher, C. A. B.; van Bentum, P. H. M.; Brinkman, K.; op de Coul, E. L.; van der Ende, M. E.; Hoepelman, I. M.; van Kasteren, M.; Juttmann, J.; Kuipers, M.; Langebeek, N.; Richter, C.; Santegoets, R. M. W. J.; Schrijnders-Gudde, L.; Schuurman, R.; van de Ven, B. J. M.; Åsjö, Birgitta; Ormaasen, V.; Aavitsland, P.; Horban, A.; Stanczak, J. J.; Stanczak, G. P.; Firlag-Burkacka, E.; Wiercinska-Drapalo, A.; Jablonowska, E.; Malolepsza, E.; Leszczyszyn-Pynka, M.; Szata, W.; Camacho, Ricardo J.; Palma, C.; Borges, F.; Paix̃ao, T.; Duque, V.; Araújo, F.; Jevtovic, D. J.; Salemovic, D.; Stanekova, D.; Habekova, M.; Mokráš, Miloš; Truska, P.; Poljak, M.; Babic, Dunja Z.; Tomazic, J.; Vidmar, L.; Karner, P.; Clotet, B.; Gutíerrez, C.; deMendoza, C.; Erkicia, I.; Domingo, P.; Camino, X.; Galindo, M. J.; Blanco, J. L.; Leal, M.; Masabeu, A.; Guelar, A.; Llibre, J. M.; Margall, N.; Iribarren, J. A.; Gutierrez, S.; Baldov́i, J. F.; Pedreira, J. D.; Gatell, J. M.; Moreno, S.; de Mendoza, C.; Soriano, V.; Ruiz, L.; Albert, Jan; Blaxhult, A.; Heidarian, A.; Karlsson, A.; Aperia-Peipke, K.; Bergbrant, I. -M; Gissĺen, M.; Svennerholm, M.; Björkman, Per; Bratt, G.; Carlsson, M.; Ekvall, H.; Ericsson, M.; Ḧofer, M.; Johansson, B.; Sonnerb̈org, A.; Kuylenstierna, N.; Ljungberg, B.; Mäkitalo, S.; Strand, A.; Öberg, S. (2012)
      Background: The effect of drug resistance transmission on disease progression in the newly infected patient is not well understood. Major drug resistance mutations severely impair viral fitness in a drug free environment, ...
    • Article  

      Use of molecular beacons and multi-allelic real-time PCR for detection of and discrimination between virulent Bacillus anthracis and other Bacillus isolates 

      Hadjinicolaou, Andreas V.; Demetriou, Victoria L.; Hezka, Johana; Beyer, W.; Hadfield, T. L.; Kostrikis, Leontios G. (2009)
      The awareness of the threat of Bacillus anthracis, the causative agent of the disease anthrax, as a biowarfare and bioterrorism weapon has revived the development of new technologies for rapid and accurate detection of ...