Browsing by Subject "Protein engineering"
Now showing items 1-3 of 3
-
Article
Binding free energies and free energy components from molecular dynamics and Poisson-Boltzmann calculations. Application to amino acid recognition by aspartyl-tRNA synthetase
(2001)Specific amino acid binding by aminoacyl-tRNA synthetases (aaRS) is necessary for correct translation of the genetic code. Engineering a modified specificity into aminoacyl-tRNA synthetases has been proposed as a means to ...
-
Doctoral Thesis Open Access
Development and application of efficient and accurate free-energy models and methodologies for high-throughput computational protein design
(Πανεπιστήμιο Κύπρου, Σχολή Θετικών και Εφαρμοσμένων Επιστημών / University of Cyprus, Faculty of Pure and Applied Sciences, 2020-09)Ο υπολογιστικός σχεδιασμός πρωτεϊνών (ΥΣΠ) αποτελεί σημαντικό εργαλείο της βιοτεχνολογίας, με ποικίλες πετυχημένες εφαρμογές τα τελευταία χρόνια, στις οποίες συγκαταλέγονται η δημιουργία καινούριων ή τροποποιημένων πρωτεϊνών ...
-
Doctoral Thesis Open Access
Ανάπτυξη και εφαρμογή ενός αποδοτικού και ακριβούς προτύπου έμμεσου διαλύτη της γενικευμένης προσέγγισης Born στον υπολογιστικό σχεδιασμό πρωτεϊνών
(Πανεπιστήμιο Κύπρου, Σχολή Θετικών και Εφαρμοσμένων Επιστημών / University of Cyprus, Faculty of Pure and Applied Sciences, 2011-05)Στην παρούσα διατριβή αναπτύσσουμε, ελέγχουμε και χρησιμοποιούμε μεθοδολογικές καινοτομίες και στα δύο ανωτέρω συστατικά. Αναφορικά με τις συναρτήσεις βαθμολόγησης, υλοποιούμε ένα ακριβές και υπολογιστικά αποδοτικό πρότυπο ...