• Article  

      Genotyping HIV-1 and HCV strains by a combinatorial DNA melting assay (COMA) 

      Kostrikis, Leontios G.; Shin, S.; Ho, David D. (1998)
      Background: Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) and hepatitis C virus (HCV) strains can be genetically classified into genetic lineages known as genetic types of subtypes according to phylogenetic analyses of ...
    • Article  

      Increase in transmitted resistance to non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors among newly diagnosed HIV-1 infections in Europe 

      Moutschen, M.; Frentz, D.; Van de Vijver, D. A. M. C.; Abecasis, A. B.; Albert, Jan; Hamouda, O.; Jørgensen, L. B.; Ku¨cherer, C.; Struck, D.; Schmit, J. -C; Vercauteren, J.; A˚sjo¨, B.; Balotta, Claudia; Beshkov, Danail; Camacho, Ricardo J.; Clotet, B.; Coughlan, S.; Griskevicius, A.; Grossman, Z.; Horban, A.; Kolupajeva, T.; Korn, K.; Kostrikis, Leontios G.; Liitsola, K.; Linka, M.; Nielsen, C.; Otelea, D.; Paraskevis, Dimitrios N.; Paredes, R.; Poljak, M.; Puchhammer-Sto¨ckl, E.; So¨nnerborg, A.; Stanekova, D.; Stanojevic, M.; Van Wijngaerden, E.; Wensing, A. M. J.; Boucher, C. A. B.; Puchhammer-Stockl, E.; Sarcletti, M.; Schmied, B.; Geit, M.; Balluch, G.; Vandamme, A. -M; Vercauteren, J.; Derdelinckx, I.; Sasse, A.; Bogaert, M.; Ceunen, H.; De Roo, A.; De Wit, S.; Echahidi, F.; Fransen, K.; Goffard, J. -C; Goubau, P.; Goudeseune, E.; Yombi, J. -C; Lacor, P.; Liesnard, C.; Pierard, D.; Rens, R.; Schrooten, Y.; Vaira, D.; Vandekerckhove, L. P. R.; Van den Heuvel, A.; Van Der Gucht, B.; Van Ranst, M.; Van Wijngaerden, E.; Vandercam, B.; Vekemans, M.; Verhofstede, C.; Clumeck, N.; Van Laethem, K.; Demetriades, Ioannis; Kousiappa, Ioanna; Demetriou, Victoria L.; Hezka, Johana; Bruckova, M.; Linka, M.; Machala, L.; Nielsen, C.; Jørgensen, L. B.; Gerstoft, J.; Mathiesen, L.; Pedersen, C.; Nielsen, H.; Laursen, A.; Kvinesdal, B.; Salminen, M.; Ristola, M.; Liitsola, K.; Suni, J.; Sutinen, J.; Korn, K.; Ku¨cherer, C.; Berg, T.; Braun, P.; Poggensee, G.; Da¨umer, M.; Eberle, J.; Heiken, H.; Kaiser, R.; Knechten, H.; Mu¨ller, H.; Neifer, S.; Schmidt, B.; Walter, H.; Gunsenheimer-Bartmeyer, B.; Harrer, T.; Paraskevis, Dimitrios N.; Hatzakis, Angelos E.; Magiorkinis, Emmanouil N.; Hatzitheodorou, Eleni; Haida, Catherine; Zavitsanou, Assimina; Magiorkinis, Gkikas; Lazanas, Marios C.; Chini, Maria C.; Magafas, N.; Tsogas, Nickolaos; Paparizos, Vassilios A.; Kourkounti, Sofia; Antoniadou, Anastasia C.; Papadopoulos, Antonios I.; Panagopoulos, Periklis; Poulakou, Garyphallia G.; Sakka, V.; Chryssos, Georgios; Drimis, Stylianos; Gargalianos, Panagiotis; Lelekis, Moyssis I.; Chilomenos, G.; Psichogiou, Mina A.; Daikos, George L.; Panos, George; Haratsis, G.; Kordossis, Theodore; Kontos, Athanasios N.; Koratzanis, Georgios; Theodoridou, Maria C.; Mostrou, Glykeria J.; Spoulou, Vana I.; Coughlan, S.; De Gascun, C.; Byrne, C.; Duffy, M.; Bergin, C.; Reidy, D.; Farrell, G.; Lambert, J.; O'Connor, E.; Rochford, A.; Low, J.; Coakely, P.; O'Dea, S.; Hall, W.; Grossman, Z.; Levi, I.; Chemtob, D.; Balotta, Claudia; Riva, C.; Mussini, C.; Caramma, I.; Capetti, A.; Colombo, M. C.; Rossi, C.; Prati, F.; Tramuto, F.; Vitale, F.; Ciccozzi, M.; Angarano, G.; Rezza, G.; Schmit, J. C.; Struck, D.; Hemmer, R.; Arendt, V.; Staub, T.; Schneider, F.; Roman, F.; Wensing, A. M. J.; Boucher, C. A. B.; van Kessel, A.; van Bentum, P. H. M.; Brinkman, K.; op de Coul, E. L.; van der Ende, M. E.; Hoepelman, I.; van Kasteren, M.; Juttmann, J.; Kuipers, M.; Langebeek, N.; Richter, C.; Santegoets, R.; Schrijnders-Gudde, L.; Schuurman, R.; van de Ven, B. J. M.; A˚sjo¨, B.; Ormaasen, V.; Aavitsland, P.; Horban, A.; Stanczak, J. J.; Stanczak, G. P.; Firlag-Burkacka, E.; Wiercinska-Drapalo, A.; Jablonowska, E.; Malolepsza, E.; Leszczyszyn-Pynka, M.; Szata, W.; Camacho, Ricardo J.; Palma, C.; Borges, F.; Paixa&tild; o, T.; Duque, V.; Araújo, F.; Jevtovic, D.; Salemovic, D.; Stanekova, D.; Habekova, M.; Mokráš, Miloš; Truska, P.; Poljak, M.; Lunar, M.; Babic, Dunja Z.; Tomazic, J.; Vidmar, L.; Vovko, T.; Karner, P.; Clotet, B.; Domingo, P.; Galindo, M. J.; Miralles, C.; del Pozo, M. A.; Ribera, E.; Iribarren, J. A.; Ruiz, L.; de la Torre, J.; Vidal, F.; Garcia, F.; Paredes, R.; Albert, Jan; Heidarian, A.; Aperia-Peipke, K.; Axelsson, M.; Mild, M.; Karlsson, A.; So¨nnerborg, A.; Thalme, A.; Nave´r, L.; Bratt, G.; Karlsson, A.; Blaxhult, A.; Gissle´n, M.; Svennerholm, B.; Bergbrant, I.; Björkman, Per; Sa¨ll, C.; Mellgren, A˚; Lindholm, A.; Kuylenstierna, N.; Montelius, R.; Azimi, F.; Johansson, B.; Carlsson, M.; Johansson, E.; Ljungberg, B.; Ekvall, H.; Strand, A.; Ma¨kitalo, S.; o¨berg, S.; Holmblad, P.; Ho¨fer, M.; Holmberg, H.; Josefson, P.; Ryding, U. (2014)
      Background: One out of ten newly diagnosed patients in Europe was infected with a virus carrying a drug resistant mutation. We analysed the patterns over time for transmitted drug resistance mutations (TDRM) using data ...
    • Article  

      Limited cross-border infections in patients newly diagnosed with HIV in Europe 

      Moutschen, M.; Frentz, D.; Wensing, A. M. J.; Albert, Jan; Paraskevis, Dimitrios N.; Abecasis, A. B.; Hamouda, O.; Jørgensen, L. B.; Kücherer, C.; Struck, D.; Schmit, J. -C; Åsjö, Birgitta; Balotta, Claudia; Beshkov, Danail; Camacho, Ricardo J.; Clotet, B.; Coughlan, S.; De Wit, S.; Griskevicius, A.; Grossman, Z.; Horban, A.; Kolupajeva, T.; Korn, K.; Kostrikis, Leontios G.; Liitsola, K.; Linka, M.; Nielsen, C.; Otelea, D.; Paredes, R.; Poljak, M.; Puchhammer-Stöckl, E.; Sönnerborg, A.; Stanekova, D.; Stanojevic, M.; Vandamme, A. -M; Boucher, C. A. B.; Van de Vijver, D. A. M. C.; Balluch, G.; Vandamme, A. -M; Vercauteren, J.; Derdelinckx, I.; Sasse, A.; Bogaert, M.; Ceunen, H.; De Roo, A.; De Wit, S.; Echahidi, F.; Fransen, K.; Goffard, J. -C; Goubau, P.; Goudeseune, E.; Yombi, J. -C; Lacor, P.; Liesnard, C.; Pierard, D.; Rens, R.; Schrooten, Y.; Vaira, D.; Vandekerckhove, L. P. R.; Van den Heuvel, A.; Van Der Gucht, B.; Van Ranst, M.; Van Wijngaerden, E.; Vandercam, B.; Vekemans, M.; Verhofstede, C.; Clumeck, N.; Van Laethem, K.; Demetriades, Ioannis; Kousiappa, Ioanna; Demetriou, Victoria L.; Hezka, Johana; Bruckova, M.; Linka, M.; Machala, L.; Nielsen, C.; Jørgensen, L. B.; Gerstoft, J.; Mathiesen, L.; Pedersen, C.; Nielsen, H.; Laursen, A.; Kvinesdal, B.; Salminen, M.; Ristola, M.; Liitsola, K.; Suni, J.; Sutinen, J.; Korn, K.; Kücherer, C.; Berg, T.; Braun, P.; Poggensee, G.; Däumer, M.; Eberle, J.; Hamouda, O.; Heiken, H.; Kaiser, R.; Knechten, H.; Müller, H.; Neifer, S.; Schmidt, B.; Walter, H.; Gunsenheimer-Bartmeyer, B.; Harrer, T.; Paraskevis, Dimitrios N.; Hatzakis, Angelos E.; Magiorkinis, Emmanouil N.; Hatzitheodorou, Eleni; Haida, Catherine; Zavitsanou, Assimina; Magiorkinis, Gkikas; Lazanas, Marios C.; Chini, Maria C.; Magafas, N.; Tsogas, Nickolaos; Paparizos, Vassilios A.; Kourkounti, Sofia; Antoniadou, Anastasia C.; Papadopoulos, Antonios I.; Panagopoulos, Periklis; Poulakou, Garyphallia G.; Sakka, V.; Chryssos, Georgios; Drimis, Stylianos; Gargalianos, Panagiotis; Lelekis, Moyssis I.; Chilomenos, G.; Psichogiou, Mina A.; Daikos, George L.; Panos, George; Haratsis, G.; Kordossis, Theodore; Kontos, Athanasios N.; Koratzanis, Georgios; Theodoridou, Maria C.; Mostrou, Glykeria J.; Spoulou, Vana I.; Coughlan, S.; De Gascun, C.; Byrne, C.; Duffy, M.; Bergin, C.; Reidy, D.; Farrell, G.; Lambert, J.; O'Connor, E.; Rochford, A.; Low, J.; Coakely, P.; O'Dea, S.; Hall, W.; Grossman, Z.; Levi, I.; Chemtob, D.; Balotta, Claudia; Franzetti, M.; Lai, A.; Binda, F.; Tramuto, F.; Ciccozzi, M.; Mussini, C.; Angarano, G.; Rezza, G.; Schmit, J. C.; Struck, D.; Hemmer, R.; Arendt, V.; Staub, T.; Schneider, F.; Roman, F.; Wensing, A. M. J.; Boucher, C. A. B.; van Kessel, A.; van Bentum, P. H. M.; Brinkman, K.; de Coul, E. L.; van der Ende, M. E.; Hoepelman, I. M.; van Kasteren, M.; Juttmann, J.; Kuipers, M.; Langebeek, N.; Richter, C.; Santegoets, R. M. W. J.; Schrijnders-Gudde, L.; Schuurman, R.; van de Ven, B. J. M.; Åsjö, Birgitta; Ormaasen, V.; Aavitsland, P.; Horban, A.; Stanczak, J. J.; Stanczak, G. P.; Firlag-Burkacka, E.; Wiercinska-Drapalo, A.; Jablonowska, E.; Malolepsza, E.; Leszczyszyn-Pynka, M.; Szata, W.; Camacho, Ricardo J.; Palma, C.; Borges, F.; Paixão, T.; Duque, V.; Araújo, F.; Jevtovic, D.; Salemovic, D.; Stanekova, D.; Habekova, M.; Mokráš, Miloš; Truska, P.; Poljak, M.; Lunar, M.; Babic, Dunja Z.; Tomazic, J.; Vidmar, L.; Vovko, T.; Karner, P.; Clotet, B.; Domingo, P.; Galindo, M. J.; Miralles, C.; del Pozo, M. A.; Ribera, E.; Iribarren, J. A.; Ruiz, L.; de la Torre, J.; Vidal, F.; Garcia, F.; Paredes, R.; Albert, Jan; Heidarian, A.; Aperia-Peipke, K.; Axelsson, M.; Mild, M.; Karlsson, A.; Sönnerborg, A.; Thalme, A.; Navér, L.; Bratt, G.; Karlsson, A.; Blaxhult, A.; Gisslén, M.; Svennerholm, B.; Bergbrant, I.; Björkman, Per; Säll, C.; Mellgren, Å.; Lindholm, A.; Kuylenstierna, N.; Montelius, R.; Azimi, F.; Johansson, B.; Carlsson, M.; Johansson, E.; Ljungberg, B.; Ekvall, H.; Strand, A.; Mäkitalo, S.; öberg, S.; Holmblad, P.; Höfer, M.; Holmberg, H.; Josefson, P.; Ryding, U. (2013)
      Background: International travel plays a role in the spread of HIV-1 across Europe. It is, however, not known whether international travel is more important for spread of the epidemic as compared to endogenous infections ...
    • Article  

      Molecular epidemiology of hepatitis C infection in cyprus: Evidence of polyphyletic infection 

      Demetriou, Victoria L.; Van De Vijver, D. A. M. C.; Kostrikis, Leontios G.; Chimonides, S.; Evgeniou, N. A.; Hadjigeorgiou-Vounou, E.; Koliou-Mazeri, M.; Papakyriakou, P.; Petsas, L.; Potamitis, G. (2009)
      The genetic diversity of the hepatitis C virus (HCV) in Cyprus is investigated for the first time in this study. Nucleotide sequence analysis of the CORE-E1 and NS5B regions of the HCV genome was performed on blood plasma ...
    • Article  

      Transmission of drug-resistant HIV-1 is stabilizing in Europe 

      Vercauteren, J.; Wensing, A. M. J.; Van De Vijver, D. A. M. C.; Albert, Jan; Balotta, Claudia; Hamouda, O.; Kücherer, C.; Struck, D.; Schmit, J. -C; Åsjö, Birgitta; Bruckova, M.; Camacho, Ricardo J.; Clotet, B.; Coughlan, S.; Grossman, Z.; Horban, A.; Korn, K.; Kostrikis, Leontios G.; Nielsen, C.; Paraskevis, Dimitrios N.; Poljak, M.; Puchhammer-Stöckl, E.; Riva, C.; Ruiz, L.; Salminen, M.; Schuurman, R.; Sonnerborg, A.; Stanekova, D.; Stanojevic, M.; Vandamme, A. M.; Boucher, C. A. B. (2009)
      The SPREAD Programme investigated prospectively the time trend from September 2002 through December 2005 of transmitted drug resistance (TDR) among 2793 patients in 20 European countries and in Israel with newly diagnosed ...